优秀的家学传承，正规的院校教育，赋予了何老坚实的中医基础；广博的学识，丰富的阅历，让何老对中医经典及各家学说有了深邃的见解。最后，何老以第一部中医临床内科杂病学专著、中医四大经典之一的《金匮要略》为研究重点，开始了自己的探索之旅。1958年，何老编撰出版了新中国第一部《金匮要略》读物——《金匮要略通俗讲话》。此书以白话形式对《金匮要略》原文进行全面译释，极大地方便了初学者，在《金匮要略》流传史上亦是第一次全文白话。接着，何老又整理出版了《金匮归纳表》，第一次以图表例示的形式全面阐述《金匮要略》之学术体系与要点，提纲挈领，精要独到。1982年，由何老编撰的《金匮要略新解》正式出版。此书以《金匮要略》历代注家为依托，结合何老自己三十余年研究《金匮要略》、临床实践之经验，并纵横联系《内经》、《伤寒论》等经典，不但提出了许多崭新的见解，而且为《金匮要略》研究提供了崭新的思路。1985年，何老编撰的《金匮要略提要便读》、《金匮要略讲义》二书，分别由北京科学技术出版社、湖南科学技术出版社正式出版，供西学中及短期学习中医使用，为《金匮要略》的教材编撰探索出了一种沿用至今的范式。同年，应日本汉方医界和东京医校邀请，何老前往日本讲学，为日本学者作“《金匮要略》之研究”的学术报告。精到的研究，丰富的成果，生动的报告，何老因此被日本学者誉为“中国研究《金匮要略》的第一人”，深得日本学者的尊敬与推崇。1991年，受国家中医药管理局委托，何老主编的《金匮要略校注》、《金匮要略语译》二书由人民卫生出版社正式出版，其中《金匮要略校注》一书获国家中医药管理局科技进步二等奖（部级），并成为目前校注《金匮要略》的最权威版本。由此，也正式确立了何老《金匮要略》学术权威、研究《金匮要略》第一人的坚实地位。同年，《金匮要略新解》日文版由日本东洋学术出版社出版发行，成为日本医生学习中医的教材。1992年，何老主编的《金匮要略百家医案评议》由浙江科学技术出版社出版，该书为学习者更好地将《金匮要略》之理法方药运用于临床提供了直接借鉴的途径。而后收于《何任临床经验辑要》一书中的《金匮燃犀录》，通过摭拾历代名家探究《金匮要略》之卓见，并酌加按语，把《金匮要略》的研究推向了更高更深的层次。
何老精研《金匮》，以《金匮》为学术之核心，但并不排斥其他经典及诸家学说。恰恰相反，何老始终尊奉各大经典，博采诸家学说。《内经》原文，何老朗朗上口；温病学说，何老运用自如。如对湿温证，何老辨治多运用江南温病学派之法则，轻清渗解。何老认为：“湿温乃湿热之邪所致的热病，故其辨证亦以卫气营血与三焦为要点，一般同温病辨证。即疾病初起，邪在上焦和卫分，尚属轻浅；随着病证演变，则入中焦与气分，其病情渐见转重；若病邪进而深入下焦或营血分，此时病已深沉。”“初起内外合邪，湿遏卫气时，宜芳香宣透以化表里之湿。表证解除后，则宜宣化气分湿浊，并视症状，兼佐清热。”
对于内科杂病，何老兼收博采历代各家之长。如对头痛，何老极为推崇《此事难知·诸经头痛》的辨治心得。他说：“头痛之治，余认为《此事难知·诸经头痛》之说虽嫌笼统，但颇可作临诊用方用药之参考。”而对喘证的治疗，何老又综合诸家，实喘用《伤寒论》之小青龙汤或《金匮要略》之苓桂术甘汤，虚喘用《局方》之黑锡丹或《卫生宝鉴》之人参蛤蚧散，寒喘用《医心方》之覆杯汤等。
对于妇科经带胎产诸证，何老尤其推崇陈自明、傅青主的辨治经验。他认为：“概论妇科各病者，始于宋·陈自明《妇人大全良方》。是书承袭前代医家学说，博采诸善，附以家传验方，为后世妇产科奠定了基础……其后颇为闻名之妇科佳著，当推《傅青主妇科》。其立论定方，均不落古人窠臼，用药纯和，无一峻品，辨证详明，易于了解，对后世妇科临床影响深远。”
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