然而，蒋介石的手谕并未得到切实执行。1930年3月23日，教育部再变换名称，发出第351号训令，要求中医学校一律改称“学社”。各地中医药界纷纷致电质问，广东中医药专门学校也于4月18日召开会议，议决：“联合省港医药团体，分呈国民政府行政院、立法院力争，并致函全国医药团体，一致进行，以厚声势。学校暂照旧办理。”[38]
当时，以广东国医国药团体名义联合向国民政府发出的电文说：“查学社名称，纯属会社性质，并非学校性质，直是将中医教育消灭于无形。且各省中医学校有前经政府准予立案，办理多年，成绩昭著。倘一旦废止，将置此失学生徒于何地？”“中国医药论实与民族民生有绝大之关系，况经历代贤哲之发明，数千年疗治之经验，成效昭著，无俟赘陈，只以医理深奥，学术纷歧，初学猝难领会，必须将我国固有之学说加以整理，使成为有系统之科学，然后中医有改善之可言，是兴学育才为今日急不容缓之举。惟规程未定，学者无所率循，理合陈述意见，呈请主席察核。伏祈饬立法院颁行中医学校规程，以资遵守。其立法院未颁布规程以前，各省中医学校曾经政府准予立案者，仍准维持现状，以免纷更为公便。”[39]
但是这些请求并未取得成效。教育部坚持要求执行第351号令。在此情况下，全国许多中医学校不得不更改名称。8月12日，广州市卫生局派员到广东中医药专门学校，要求尽快改名，停止用学校名义招生。谢炜南先生回忆：“当时的市卫生局派了一个科长到广东中医药专门学校，硬把招牌拆下，换上一个‘广东中医药学社’的招牌。”[40]广东省教育厅亦多次要求执行。鉴于情势，学校于8月14日召开董事会商议，不得不决定“暂改名广东中医药学社”，[41]仍以陈任枚为社长，当年以学社名义招生。8月25日，校长陈任枚向全校发出布告：
为布告事。前奉广东教育厅训令，略称中医学校改称学社，经教育部、卫生部会呈行政院转呈国民政府批准在案，饬遵照改易名称等因。旋接全国医药总会函称，叠（迭）接各省医药团体函电，请求代达政府暂缓变更中医学校名称，经由会据情转达教育部察核等由，本校以总会既经呈请暂缓变更学校名称，应听候部批，再行遵办。且当暑假期内，一切校务均暂行停顿，故暂未改名称。八月十二日，广州市卫生局派卫生第三区黎主任启康到校，促令改易学社名称暨停止用学校名义招生等语，旋再奉教育厅令饬，迅即改称中医学社以符部令等因。业经校董会开会讨论，佥谓学校改称学社，既经国府核准，本校自当遵行，且全国中医学校均已改易名称，本校更不能独异。此本校改称学社之原委也……该项中医学社既为传习医学而设，自可招收学习生，并延请导师指导学习……似此名称虽易，而研究学术、培植人才之宗旨并无变更。[42]
“广东中医药学社”时期印行的教材
布告虽详细介绍了改名经过，并称改名不影响教学功能，但事实上已不能称学生、教授，只能称学习生、导师了。因此，布告进一步说，全国医药界正努力争取成立国医馆，相信“剥极必复”，前景可期，勉励“各生务须潜心学业，力挽颓波，有厚望焉”。
学校改名给学生带来一定影响，部分学生因此觉得前途莫测而退学。该校学生郑炎痛惜学校“医科大学所应有者，罔不毕具”，“徒以受恶势力之摧残，至今犹称学社，可不惜哉！夫以健全医校如是校者，犹未能与国之医大平衡看待，其次焉者，更复奚望哉！”[43]
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