1956年广州中医学院成立时，广东省中医进修学校并没有取消，而是继续招收学员开展中医进修工作。1957年，原第二副校长康守忠调离，萧潇接任第二副校长。
进修学校欢送下放干部，后排从左至右为萧潇、罗元恺、邓铁涛
1956—1957年除开办中医进修班、针灸班外，1956年还为各市县开设了一个师资班。
中医学院方面，随着工作的开展，仅靠筹备委员会已不能适应工作需要。1957年，广州中医学院成立了党委以加强领导，刘汝琛任党委书记，并增补为筹委会副主任。
1957年5月，罗元恺、邓铁涛在一次座谈会上提出，将中医进修学校定位为中等专业学校是王斌时期的政策，建议更改名称为中医进修学院，改善待遇。罗元恺指出：“全国1950年、1951年就成立了中医进修学校，当时王斌思想严重，而决定为中等专业学校，至今未明确。中医进修学校的学员都是开业中医师，高级知识分子，再进修还是中等人才，各种待遇也按中等专业学校是不合理的。如教师进修均叫老师进修学院。”[85]
1957年第6期乙一班毕业合照
除了建设将学校改名为中医进修学院，罗元恺还提出要适当合并广州各中医单位，以统一力量，可考虑将进修学校合并到中医学院。也有与会人员建议要加强中医研究力量，“应将中医学院、中医进修学校、中医实验医院三个单位一起研究”等。
1958年1月29日，广东省卫生厅发文，为集中人力、物力，取得统一领导，对部分单位进行调整，决定：“中医实验医院作为中医学院的教学医院（以后并取消实验医院的名称），中医进修学校为中医学院的进修部。”[86]
2月4日，由广州中医学院组织召开会议，进修学校校长罗元恺在会上表示：“我们的学校能和中医学院合并，我们一致拥护。卫生厅通知后，让同志们讨论过一次，大家都很希望合并，目前已做准备清点，以做交待。我感觉合并对于精简机构、搞好教学（有好处），我们的老师都互相兼课，在物资方面有些财产仪器可以提高使用率。如我们有70多台显微镜，每周才用一二次，合起来以后，可以节省物力。”[87]
合后成立合并接交领导小组，分人员编制、财务预算和物资清点三个小组进行合并交接工作。同时形成合并方案上报。方案中关于中医进修学校的部分如下：
将学校并入学院，成立学院进修部，设正、副主任分管进修部业务和政治思想工作，其他人员根据需要配备调整，力求精简为原则。
教学工作：各中医和基础课教师分别编入各教研组，进修部教学工作由学院统一安排，各教研组负责。
行政工作：并入学院行政各科，由学院统一安排，各科负责。[88]
从1958年4月起，广东中医进修学校正式合并成为广州中医学院进修部，并决定于广州中医学院三元里校区建成后随迁往新校区。进修部设正、副主任负责工作，各中医及基础课教师则编入学院教研组，进修部教学工作由学院统一安排。广东中医实验医院改称广州中医学院附属医院，为学院下属单位，资产不变，但应报学院备案。
当时中医进修学校的人员中，职员有副校长罗元恺、萧潇，教务员彭祖年，办事员伍彩棠、欧阳介棋，工友林榜享、蔡奕，以及被定为右派的黄德全；中医教师有李藻云、刘仕昌、郑玉航、关汝耀、伍华生、伍律宁。
广州中医学院进修部成立后，制定了全省中医分层次进修的工作规划：“各县市办理较短期的（半年）初级中医进修班，各专区负责办理相当于中级的中医进修学校（学习时间一年），进修部则重点培养中医师资人才（学习时间一年，全部中医课程），同时办理一些要求较高的中医进修班，学习时间两年，毕业后达到中医专科毕业的水平。中医课占70%，现代医学基础课占30%。”[89]
1958年进修部招收了学制两年的中医进修班，1958年秋季和1959年春季招收了两期学制一年的中医师资班，1959年招收了为期三个月的针灸师资班。进修部在“文化大革命”前一直存在，但“文化大革命”后重新恢复机构时未再设立。
到此为止，发轫于1924年的广东中医药专门学校，历经不同的发展时期，终于完全地融入到了新中国中医高等教育之中。
1962—1963年广州中医学院架构图（部分），进修部被列为附属单位
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