1．生物碱的提取方法
（1）水或酸水提取：提取原理是生物碱盐类易溶于水，难溶于有机溶剂；其游离碱易溶于有机溶剂，难溶于水。
（2）醇类溶剂：本法基于生物碱及其盐类易溶于甲醇或醇。故用醇代替水或酸水提取生物碱。
（3）亲脂性有机溶剂提取：一般操作方法是将提取材料用碱水（石灰乳、Na2CO3溶液或10%氨水等）润湿后，再用有机溶剂如CH2Cl2、CHCl3、CCl4或苯等直接进行固－液提取。回收有机溶剂后即得亲脂性总生物碱。
（4）雷氏铵盐法（2010年）：季胺生物碱常采用沉淀法进行提取。操作如下：①将季胺生物碱的水溶液，用酸水调到弱酸性，加入新鲜配制的雷氏铵盐饱和水溶液至不再生成沉淀为止。滤取沉淀，用少量水洗涤1～2次，抽干，将沉淀溶于丙酮（或乙醇）中，过滤，滤液即为雷氏生物碱复盐丙酮（或乙醇）溶液。②向此滤液中，加入Ag2SO4饱和水液，形成雷氏铵盐沉淀，滤除，滤液备用。③向滤液中加入计算量BaCl2溶液，滤除沉淀，最后所得滤液即为季胺生物碱的盐酸盐。
2．生物碱的分离方法（2006，2012年）
（1）利用生物碱的碱性差异进行分离：可采用在不同的pH下，用水不溶性有机溶剂萃取进行生物碱的分离。若欲利用这种方法系统分离生物碱，则常采用pH梯度萃取。
（2）利用生物碱及其盐溶解度的差异进行分离：某些生物碱对有机溶媒的溶解度不同，由此可以将它们彼此分离。
（3）色谱法：该法广泛地用于生物碱的分离。绝大多数采用吸附色谱，但应用分配色谱的实例亦不少。高速逆流色谱仪的出现，则更开拓了这方面的应用。吸附剂多用硅胶、氧化铝、纤维素、聚酰胺等。
（4）高效液相色谱法（HPLC）：高效液相色谱法具有分离效能好、灵敏度高、分析速度快的优点，能使很多其他色谱法难分离的混合生物碱得到分离。HPLC法分离生物碱时，可用硅胶吸附色谱柱，也可用C18反相色谱柱。
（5）其他方法：利用使欲分离生物碱分子中某种基团如羟基、内酯或内酰胺等，发生可逆性化学转换的方法进行分离。如苦参碱分离中应用内酰胺开环－闭环反应等。
3．水溶性生物碱的分离 水溶性生物碱主要指季铵碱，常在提取脂溶性生物碱后的碱液中用沉淀法或溶剂法进行分离。
（1）沉淀法：利用水溶性生物碱可与生物碱沉淀试剂反应，生成难溶于水的复合物而从水中沉淀析出，与留在滤液中的水溶性杂质分离，以获得纯度较高的水溶性生物碱或其盐。实验室中常用雷氏铵盐沉淀试剂纯化季铵碱。
（2）溶剂法：利用水溶性生物碱能够溶于极性较大而又与水分层的有机溶剂（如正丁醇、异戊醇或氯仿-甲醇的混合溶剂等）的性质，用这类溶剂与含水溶性生物碱的碱水液反复萃取，使水溶性生物碱与强亲水性的杂质得以分离。
4．生物碱的色谱检识 生物碱的检识常用方法有薄层色谱法、纸色谱法、高效液相色谱法、气相色谱法等。薄层色谱中，多数采用吸附色谱，吸附剂多用硅胶、氧化铝，适用于检识和分离脂溶性生物碱；但应用分配色谱的实例亦不少，适用于分离和检识极性较大的生物碱。纸色谱法多为正相分配色谱，适用于检识和分离水溶性生物碱、生物碱盐和弱亲脂性生物碱。
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