【摘要】：在这种双螺旋结构中，亲水的脱氧戊糖基和磷酸基位于双螺旋的外侧，而碱基朝向内侧。一条链的碱基与另一条链的碱基通过氢键结合成对，碱基对的平面与螺旋结构的中心轴垂直。由于碱基对的方向性，碱基对所占据的空间是不对称的，因此在双螺旋的外部形成了一个大沟和一个小沟。配对的多核苷酸链形成双螺旋结构，不能配对的碱基则形成突环。
三、核酸的二级结构
核酸链在氢键的维持下，形成复杂的高级结构——二级和三级结构。
1.DNA的双螺旋结构 DNA分子由两条核苷酸链组成，它们沿着一个共同轴心以反平行走向盘旋成右手双螺旋结构（图1－6－1）。在这种双螺旋结构中，亲水的脱氧戊糖基和磷酸基位于双螺旋的外侧，而碱基朝向内侧。一条链的碱基与另一条链的碱基通过氢键结合成对，碱基对的平面与螺旋结构的中心轴垂直。
配对碱基始终是腺嘌呤（A）与胸腺嘧啶（T）配对，形成两个氢键，鸟嘌呤（G）与胞嘧啶（C）配对，形成3个氢键。有几何形状的限制，只能由嘌呤和嘧啶配对才能使碱基对合适地安置在双螺旋内（图1－6－2）。
沿螺旋轴方向观察，碱基对并不充满双螺旋的空间。由于碱基对的方向性，碱基对所占据的空间是不对称的，因此在双螺旋的外部形成了一个大沟和一个小沟。这些沟对DNA和蛋白质的相互识别是非常重要的。因为只有在沟内才能觉察到碱基的顺序，而在双螺旋的表面，是脱氧核糖和磷酸的重复结构，不可能提供信息。
2.RNA的二级结构 大多数天然RNA以单链形式存在，但在单链的许多区域可发生自身回折，在回折区内，可以相互配对的碱基以A—U与G—C配对，分别形成两个或3个氢键。配对的多核苷酸链（占40%～70%）形成双螺旋结构，不能配对的碱基则形成突环（图1－6－3）。
1－6－1 DNA双螺旋结构示意图
图1－6－2 DNA双螺旋分子的碱基配对
图1－6－3 RNA的二级结构
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