第四节 线粒体DNA的提取
线粒体DNA是染色体遗传物质,哺乳类动物的线粒体DNA为共价闭合环状的双链DNA。它变异快、结构相对简单,经母系遗传,对真核生物基因组的结构、复制、转录、调控机理等方面都起着重要作用。近年来被广泛用于近缘种间或种内种群间亲缘关系的研究。
线粒体DNA最早是用氯化铯梯度离心方法获得,该法提取的线粒体DNA纯度高,但所需仪器设备昂贵,实验周期长,限制其在群体遗传研究中的应用。继而出现了Triton法、碱变性法与改进高盐沉淀法等线粒体DNA的提取方法。
一、碱变性法线粒体DNA提取的原理
线粒体DNA的结构与质粒DNA的结构相似,均为共价闭合环状的双链DNA,实验原理与质粒DNA提取相同。
二、主要实验步骤
1.材料:新鲜小鼠肝组织。
2.仪器:玻璃匀浆器、高速离心机、离心管、吸管。
3.试剂:50mmol/L葡萄糖、10mmol/L Na2EDTA,25mmol/L Tris-HCl pH 8.0、1%SDS、0.2mol/L NaOH、3mol/L NaAc pH4.8、95%乙醇、75%乙醇、TE缓冲液。
4.主要步骤
(1)取50mg新鲜小鼠肝组织,加1ml冷匀浆液,用玻璃匀浆器匀浆,随即以1 000g×3min,4℃,离心,弃沉淀。
(2)取上清液,12 000g×10min,4℃,离心,沉淀即为粗线粒体。
(3)将沉淀溶于100ml(50mmol/L葡萄糖、10mmol/L Na2EDTA,25mmol/L Tris-HCl pH8.0)溶液中,充分混匀。
(4)加200ml新鲜配制的(1%SDS,0.2mol/L NaOH)溶液,轻轻摇匀,冰浴5min。
(5)再加150ml(3mol/L NaAc pH4.8)溶液,轻轻摇匀,冰浴5min。12 000g×10min,4℃,离心。
(6)取上清液加等体积(酚、氯仿、异戊醇之体积比为25∶24∶1)溶液,抽提2~4次,界面无白色物质,10 000g×5min离心。
(7)取上清液加2倍体积95%乙醇,室温静置15min,然后12 000g×10min离心。
(8)弃上清液,沉淀用75%乙醇洗涤1次,以12 000g×5min离心。
(9)弃上清液,取沉淀,真空干燥后即得线粒体DNA。将其溶于适量的TE缓冲液中,-20℃保存。
5.实验结果鉴定:用紫外分光光度仪测定,A260∶A280为2.0左右。若纯度较高,能直接用限制性内切酶进行酶切图谱分析。
(上海中医药大学 王晓玲)
免责声明:以上内容源自网络,版权归原作者所有,如有侵犯您的原创版权请告知,我们将尽快删除相关内容。