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常用中外文信息检索系统

时间:2023-05-14 理论教育 版权反馈
【摘要】:《中国生物医学文献数据库》是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库,是国内第一个综合性中文生物医学文献光盘数据库,也是目前国内最大的医药卫生专业文献数据库。中文主题词轮排表:在输入框键入检索词后,点“查找”,系统显示含有该检索词的中文主题词轮排表。认真阅读主题词的注释信息,确认是否和检索主题一致。

17.3 常用中外文信息检索系统

17.3.1 中国生物医学文献数据库(CBM)

1)数据库简介

《中国生物医学文献数据库》(简称CBM)是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库,是国内第一个综合性中文生物医学文献光盘数据库,也是目前国内最大的医药卫生专业文献数据库。该数据库收录了1978年以来1 600多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约40万条,数据总量达350余万篇,学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识管理,全部题录均根据美国国立医学图书馆的《医学主题词表》(MeSH词表)、中国中医研究院图书情报研究所出版的《中医药主题词表》进行主题标引,并根据《中国图书馆分类法·医学专业分类表》进行分类标引。

中国生物医学文献数据库具有主题、分类、期刊、作者等多种词表辅助查询功能,检索入口多、方式灵活,可满足简单检索和复杂检索的需求,与PUBMED具有良好兼容性,可获得较高的查全率和查准率。目前,常用的有两个版本,即基于局域网的CBMWin和基于因特网的CBMWeb,网络版网址:http://cbmwww.imicams.ac.cn/。

2)数据库检索

在“中国生物医学文献数据库”登录主界面输入用户名和密码,登录后系统默认为基本检索界面,在数据库标题下方分别可以切换为主题检索、分类检索、期刊检索、作者检索、索引检索。

(1)基本检索

①选择检索入口。

缺省:表示输入的检索词同时在中文题目、文摘、主题词、特征词、关键词、期刊这些主要入口检索。

全部:表示输入的检索词同时在所有可检索的字符型字段中查找。

指定入口:表示输入的检索词仅在某一指定入口内检索,包括题目、英文题目、作者、地址、关键词、文摘、基金、参考文献、刊名、出版年、期、分类号、主题词、特征词等。如图17-3。

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图17-3 中国生物医学文献数据库选择检索入口

②在输入框键入检索词或检索式,检索词本身可使用通配符,检索词之间可使用逻辑运算符。

通配符:

a.单字通配符(?):替代一个字符。如检索式“血?动力”,可检索出含有“血液动力、血流动力”等字符串的文献。b.任意通配符(*):替代任意一个字符。如检索式“肝炎*疫苗”,可检索出含有“肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗”等字符串的文献等。

逻辑运算符:

a.逻辑运算符:AND——检出记录中同时含有检索词A和检索词B。OR——检出记录中含有检索词A或检索词B。NOT——在含检索词A的记录中,去掉含检索词B的记录。

b.优先级。优先级的顺序依次为:()>NOT>AND>OR。例:(心脏瓣膜疾病OR心力衰竭)AND手术后并发症。

③选择是否进行精确检索。

a.精确检索:检索词与检索字符串完全相等,如检索作者马智,仅检索出作者为马智的文献,而不会将作者名中含有马智的文献带出。

b.所有入口均可进行包含检索,精确检索仅限于作者、关键词、刊名、出版年、期、分类号、主题词、特征词等字段。

④二次检索:是在已有检索结果基础上再检索,逐步缩小检索范围,与上一个检索词之间的关系为“AND”。

(2)主题检索

①选择“中文主题词”或“英文主题词”检索入口,键入检索词,点击“查找”按钮。

主题检索可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找,可浏览主题词注释信息和树形结构,帮助确定恰当的主题词。还可通过设置是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词,使检索结果更符合检索要求。检索课题时应尽可能采用规范化的主题词进行检索,以提高查全率和查准率。

②在主题词轮排表中,浏览选择主题词。

中文主题词轮排表:在输入框键入检索词后,点“查找”,系统显示含有该检索词的中文主题词轮排表。同一行中,左边一列为主题词的款目词(同义词),中间一列为正式主题词,右边一列为该主题词命中的文献数。

选择“英文主题词”检索入口,在输入框键入英文检索词,点“查找”,系统显示含有该检索词的英文主题词轮排表,包括英文主题词和款目词(同义词)及主题词中译名。(见图17-4)

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图17-4 检索词的英文主题词轮排表

③在主题词注释表中,浏览主题词注释信息和树形表,选择是否扩展检索、加权检索以及副主题词和副主题词扩展检索选项。

a.主题词注释包括该主题词的中文名称、英文名称、款目词、树状结构号、相关词、可组配的副主题词、药理作用主题词、检索回溯注释、标引注释、历史注释、范畴注释等内容。认真阅读主题词的注释信息,确认是否和检索主题一致。

b.主题词扩展检索和非扩展检索:扩展检索指对当前主题词及其所有下位主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前主题词的检索。默认状态为扩展检索,若不进行扩展检索则选择“不扩展”选项。如主题词“HIV感染”,扩展检索指对该主题词和10个下位主题词检索,不扩展检索仅对“HIV感染”进行查找。

c.主题词加权检索和非加权检索:主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的主要内容。加权主题词用“*”表示,如“*肝肿瘤”。加权检索表示仅对加星号主题词(主要概念主题词)检索,非加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。默认状态为非加权检索,若进行加权检索在“加权”选框进行标记。

d.主题词/副主题词组配检索:

副主题词:用于对主题词的某一特定方面加以限制,强调主题词概念的某些专指方面。如:“肝/药物作用”表明文章并非讨论肝脏的所有方面,而是讨论药物对肝脏的影响。

主题词与副主题词的组配规则:副主题词一共有94个,表明同一主题的不同方面。主题词与副主题词的组配有严格的规定,不是所有的副主题词均能与每个主题词进行组配,“可组配副主题词”列出了当前主题词可以组配的所有副主题词,每个副主题词前面都有一个复选框,可以同时选择多个副主题词。点击某个副主题词可弹出该副主题词的注释窗口,有助于正确使用副主题词。

e.副主题词扩展检索:一些副主题词之间也存在上下位关系,如副主题词“副作用”的下位词包括“中毒”和“毒性”,选择“扩展副主题词”,指对该副主题词及其下位副主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前副主题词“副作用”。

另有分类检索、期刊检索、作者检索、索引检索等不再赘述。

17.3.2 中国知识基础设施工程(CNKI)

中国知识基础设施工程(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)的概念,源于世界银行《1998年度世界发展报告》。CNKI工程是以实现全社会知识资源传播共享与增值利用为目标的信息化建设项目,由清华大学、清华同方发起,始建于1999年6月。CNKI工程集团采用自主开发并具有国际领先水平的数字图书馆技术,建成了世界上全文信息量规模最大的“CNKI数字图书馆”,并正式启动建设《中国知识资源总库》及CNKI网格资源共享平台,为全社会知识资源高效共享提供最丰富的知识信息资源和最有效的知识传播与数字化学习平台。

CNKI系列数据库产品主要包括中国期刊全文数据库(CJFD)、中国期刊全文数据库(世纪期刊)、中国优秀博硕士学位论文全文数据库(CDMD)、中国重要会议论文全文数据库(CPCD)、中国重要报纸全文数据库(CCND)、中国年鉴全文数据库(CYFD)、中国图书全文数据库(CBFD)、中国引文数据库(CCD)等,各数据库通过KNS5.0平台强大的整合功能,将期刊库、博硕库以及其他的一些CNKI源数据库整合起来一起使用,实现知识资源的增值利用和深度挖掘。

跨库检索。通过跨库检索技术,可以实现只输入一个检索词即可在期刊、博硕论文等多个数据库里面同时检索,为读者搭建了一站式的检索平台,有效减少读者检索文献的时间。

知网节:指文章下载页面的各种超链接,通过知网节功能,实现各数据库中相关文献的链接功能,以超链接的形式将相同主题的文章直接推送到读者面前,知网节包括参考文献链接、引证文献链接、相似文献链接等。

17.3.3 生物医学文献数据库MEDLINE

MEDLINE数据库是由美国国立医学图书馆编辑建立、世界公认最权威的大型生物医学文献数据库,收录了1966年以来全世界70多个国家和地区40多种语言的文献数据。2008年Medline收录期刊5 175种,其中中国期刊100多种。MEDLINE涵盖了美国《医学索引》(Index Medicus,IM)、《牙科文献索引》(Index to Dental Literature)和《国际护理索引》(International Nursing Index)印刷本的全部数据,内容涉及临床医学、基础医学、护理学、口腔医学、药理和药剂学、环境医学、职业病学、兽医学、卫生管理、食品营养、卫生保健、信息科学等领域。截至2008年底,MEDLINE共收录数据1 700多万条,其中约80%为英文文献,近年来数据年增量约40—50多万条记录,MEDLINE光盘版数据每月更新,网络版数据每周更新。

17.3.4 PubMed检索系统

PubMed是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)附属国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发建立的生物医学文献检索系统,于1997年开始在网上向用户提供免费检索服务。PubMed是NCBI开发的Entrez检索系统的重要组成部分之一,Entrez是一个用以整合NCBI系列数据库中信息的搜寻和检索工具,这些数据库包括核酸序列、蛋白序列、大分子结构、基因组序列以及MEDLINE等。PubMed主要用于检索包括MEDLINE数据在内的期刊文献,其页面也提供了对核酸序列、蛋白序列、基因组序列、分子结构、孟德尔遗传在线等数据库的链接。PubMed系统可通过NCBI主页上的PubMed链接点击进入,也可直接键入网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed进入。PubMed收录范围:

(1)MEDLINE:收录内容如前一节所述。检索记录带有[PubMed-indexed for MEDLINE]标记。

(2)OLDMEDLINE:收录了1966年之前世界上重要的生物医学期刊文献记录150多万条,目前主要为1948~1965年的数据。检索记录也带有[PubMed-indexed for MEDLINE]标记。

(3)PreMedline:是一个临时性数据库,收录准备进行标引的文献信息,每天都在接受新数据,进行标引和加工,每周把加工好的数据加入到MEDLINE中,同时从PreMedline中删除。

(4)Publisher Supplied Citations:出版商直接提供的文献数据,带有[PubMed-as supplied by publisher]标记,若记录被PreMedline收录,加工标引完成后则进入MEDLINE中,其标记也变为MEDLINE数据标记。

17.3.5 Ovid数据库系统

Ovid Technologics公司是著名的数据库提供商,Ovid平台下提供300多个数据库,1 000多种权威期刊及其他资源,可由文献中的参考索引链接到该文献的全文(Full Text),用户可在单一环境下方便地获得所需资料。其中生物医学数据库主要有:

(1)Ovid全文期刊库(Journals@Ovid Full Text),提供60多个出版商出版的科学、技术及医学期刊1 000多种,最早的可回溯至1993年。其中包括Lippincott Williams &Wilkins(LWW)出版社的279种医学期刊、牛津大学出版社(Oxford University Press)的50多种医学期刊、以及BMJ Publishing Group Ltd.等公司出版的期刊。

(2)Ovid BP(BIOSIS Previews)数据库由美国生物学文摘生物科学信息服务社(Biosciences Information Service of Biological Abstracts,BIOSIS)编辑出版。是美国生物学文摘(Biological Abstracts,BA)和生物学文摘/报告、述评、会议资料的网络版,是世界上有关生命科学领域最大的综合性文摘数据库,内容涉及生命科学的所有领域,其中的期刊论文来源于100多个国家的5 000多种期刊,及时提供生物学及医学上的新发现和临床及实验研究资料。数据库中95%的记录有摘要。

(3)Ovid EBM Reviews(循证医学数据库集合),由Ovid技术公司提供,共包含7个数据库,其中除ACP Journal Club外,其余6个是Cochrane Library中的数据库,ACP Journal Club由两种期刊ACP Journal Club和Evidence-Based Medicine组成。这两种期刊由相关领域的专家按照严格的研究设计标准,定期从世界顶级的临床期刊中筛选出最新的系统评价和原始研究论文,并对其主要内容进行评述。

17.3.6 EMBASE

EMBASE(Excerpta Medica Database)是由荷兰Elsevier Science出版公司建立的EM的书目型数据库。EMBASE.com是将EMBASE—荷兰《医学文摘》中1 100多万条生物医学记录与700多万条独特的MEDLINE记录相结合,经过去重,形成全球最大最具权威性的生物医学与药理学文献数据库。EMBASE.com囊括了70多个国家/地区出版的7 000多种刊物,覆盖各种疾病和药物信息,涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物。

17.3.7 网上免费医学期刊全文文献的获取

1)Free Medical Journals(免费医学期刊网)

该网站由美国的Bemd Sebastian Kamps创建,网址为Http://www.freemedicaljournals.com,是提供生物医学免费电子期刊浏览的专业网站。目前收录约430种免费的全文生物医学期刊的网址链接,语种包括英语、法语、德语、意大利语、俄语等。

网站主页的左侧提供了3种期刊检索途径,用户可按专业、语种和刊名首字母进行搜索获取所需文献,其收录的期刊按其出版后的时间分为4种免费时段,该网站还提供部分期刊的影响因子(Impact Factor)。

2)HighWire Press(HighWire数据库)

该网站是由美国斯坦福大学开发与维护的全球最大的科技期刊全文网上免费虚拟数据库之一,网址为http://highwire.stanford.edu或http://highwire.org。它收集医学、生物学、物理学、社会科学领域的期刊,目前已拥有4 500多种被Medline收录的医学期刊,1 700多万篇文献和HighWire Press协助出版的411种网络学术期刊,其中有近90万篇免费期刊全文,文献右侧标美元符号的为收费文献。HighWire允许读者免费注册(建议注册,以便能充分享受其提供的服务),其首页提供了关键词、标题、摘要、作者、期刊浏览、文献浏览等多种检索途径,可根据情况进行选择。

3)Directory of Open Access Journal(DOAJ,开放存取期刊目录)

开放存取(Open Access,OA)电子期刊是近年来新出现的一种期刊出版形式,其特点是出版费用主要由论文作者支付,读者免费使用。由于OA期刊的稿件大多采用同行评审,因此不同于一般的免费期刊,OA期刊质量有所保证,利用价值较高。

DOAJ是瑞典隆德大学(Lund University)于2003年5月建立的全球OA期刊门户网站,网址为http://www.doaj.org。该网站具有免费、全文与质量保障等特点,收录的科学性及学术性期刊达3 940多种,文章已近26.5万篇。文献按学科主题分类、字顺排列,共17个一级主题类目,与生物医学相关的有生物学与生命科学(Biology and Life Sciences)及卫生科学(Health Sciences)。可通过刊名、主题等方式进行检索。

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