（一）政府IT管理的组织结构与治理
北京市农业部门应采用基于集中管理的联合管理模式。在此管理模式下，北京市农业信息化相关部门与业务、行政综合部门联合进行IT管理，各司其职。这一管理模式既保留了集中管理模式的控制能力和资源集中优势，同时又兼顾了分散管理的灵活性，其主要的组织结构、职责和制度建设有以下几个方面：
一是信息化建设领导小组。由部门主要领导挂帅，由负责业务、财务和IT等最高层领导组成，并具有重要职责。
二是信息化建设办公室。在信息中心内设立信息化领导小组办事机构，由主管IT工作的领导统一指挥，由信息中心、业务部门和行政综合部门相关人员联合组成，其主要职责为：组织制定顶层设计，协调有关部门解决在信息化建设中遇到的各种问题。
三是有关部门的职责。业务、行政综合部门与信息中心三方必须各负其责并团结协作，共同推动信息化建设工作。
四是信息化管理制度。为了保证农业信息化建设的顺利开展，根据市农委IT管理现状，迫切需要制定或改善需求管理、投资管理、整体规划等10项流程管理的制度。
（二）合作型信息服务的运行体系
北京都市型农业现代化服务的运行体系是一个联盟体系，由北京从事有关农业信息化设计、系统开发、运行、服务及基层信息网络节点等相关工作的企事业单位和机构等，按照“自愿、平等、合作”的原则，在政府协调下，自发组织的互利共同体，是从事围绕北京农业信息服务产业链相关技术研发、服务产品推广体系建设、宣贯的非技术因素的解决方案，以及行业规范、标准化制定等工作的行业性、非营利性组织。
（三）基层信息组织建设
一是基层信息站建设。
北京市农村基层信息站建设体现了多渠道投入的特点。一是北京市农业部门启动的“221信息”工程推进京郊农村建立了乡镇信息站和村级信息员信息体系，与北京市经信委共同推进的“数字家园”工程，成为农村基层信息化服务主体组织；二是北京市科委建设运营的“爱农驿站工程”，建立的部分村级信息站，主要依靠从各种便民缴费中提成，自身承担着如政策宣传等义务；三是市组织部建设的农村基层党建网，针对农村社会管理问题，以卫星视频远程教育网方式，积极与农业、水利、电信等部门合作，为农村进行党务、科技宣传和推广工作。上述这些信息化组织，基本上属于公益性服务，从不同程度促进了农村信息服务发展，但是由于村级信息站信息系统建设缺乏统筹管理，资金投入分散，规划与项目衔接不够，整体性不强，综合效能都尚未展现。从历史经验来看，农村信息站一定要与产业化现实中的实际业务结合，才能保证自身的生存和发展。
二是基层信息队伍建设。
主要包括两个方面的内容：
其一，基层信息队伍现状。随着农村城镇化和城乡一体化的发展，截至2010年，郊区农村在册村级合作经济组织4001个，村级农经信息员4651人，其中兼职4195人。鉴于村级农经信息员工作量大、素质要求高，在承担村级农村管理信息化建设任务的同时，还要承担大量市、区县、乡镇政府各级管理部门所需要的详细数据和基础信息，因此，需要给予村级农经信息员以适当的岗位补贴。从以上现状可以看出，要建立一支稳定的基层信息员队伍，就要设置相应的村级农经信息员公益岗位，从而为基层信息员提供稳定的收入和其他各种保障。
其二，基层信息员岗位的职责。主要包括：负责村级人、财、物基础信息数据库的日常管理工作；负责村级经济分析和信息服务工作；负责村级信息化软硬件设备的管理与维护三个方面。
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